Az iráni forradalom vezetője, Ruhollah Khomeini ajatollah körülbelül 89 éves korában, Teheránban egy bélműtét után elhunyt. Khomeini halálával az iszlám forradalom tíz éve után eltűnik a karizmatikus vezető a politika színpadáról. A hatóságok negyvennapos állami gyászt hirdettek meg, a teheráni rádió pedig "mindenfajta összeesküvés veszélyére" figyelmeztette a lakosságot. A hadsereg Khomeini halála után is készen áll, "hogy megvédje a forradalmat és az iszlám köztársaság határait". A június 6-i temetésen 4-5 millió gyászoló vett részt. A temetési ceremónia perzselő hőségben zajlott le, sokan meghaltak, illetve megsérültek. Khomeini halálát sokfajta reakció követte. Irak - Irán háborús ellenfele - nyílt örömének adott hangot, míg a síita muzulmánok kétségbeesetten gyászoltak. George Bush amerikai elnök egy nyilatkozatában kifejezte reményét, hogy Irán "ismét felelősségteljes szerepet fog játszani a nemzetközi közösségben". Közvetlenül a forradalom vezetőjének halála után egy 83 egyházi vezetőből álló tanácsa a 49 éves Ali Hameneit, a jelenlegi államelnököt választja meg Khomeini utódául. A mérsékeltek és a radikális fundamentalisták közti utódlási harcban átmeneti jelöltnek tartják, aki valamennyi irányzat számára elfogadható. Ezt követően sor került a Khomeini által egy kézben tartott egyházi és világi vezetés szétválasztására. Július 28-án a parlament addigi elnökét, az 55 éves Ali Akbar Haszemi Rafszandzsanit, aki egyben a hadsereg főparancsnoka, választották Irán új államelnökévé. Az alkotmány megváltoztatásával az államelnöki hivatalnak megnő a hatásköre: Rafszandzsani ezután betölti az államfői s a kormányfői tisztséget is. A változások - egyelőre legalábbis - nem változtatnak gyökeresen azon, hogy Irán továbbra is politikájában egyházi férfiúk által vezetett állam.