Az 1695-ben trónra lépő szultán legfontosabb feladatának a Habsburgok elleni küzdelmet tartotta, megpróbálta visszaszerezni az Oszmán Birodalom számára elvesztett területeket. 1697-ben személyesen vezette a Magyarországra támadó török csapatokat, azonban Zentánál katasztrofális vereséget szenvedtek. Az 1699-ben megkötött karlócai béke értelmében a szultán lemondott Magyarországról és Erdélyről, továbbá csapatait lengyel területekről is kivonta. A keleti fronton sem termett sok babér számára: Nagy Péter cár elfoglalta Azov erődjét. A kedvezőtlen események hatására Konstantinápolyban zendülés tört ki, Musztafa megpróbált rendet tenni a janicsárok között, de ők kerekedtek felül.